La mayoría de las columnas están basadas en sílice y optimizadas por los buffers presentes en los kits. Algunas de ellas están diseñadas para químicas muy específicas, mientras que otras son simplemente versiones de tamaño.

Por ejemplo, hay columnas que permiten volúmenes de elución bajo y altamente concentrado de ADN y ARN. En otros casos, contienen mayor cantidad de sílice lo que aumenta la capacidad de unión de los ácidos nucleicos. También es posible favorecer la purificación de ADN genómico de alto peso molecular. En los kits de ARN encontramos combinaciones de columnas y buffers, que permiten obtener selectivamente diferentes tipos de ARN (por tamaño), y presentan filtros específicos que permiten eliminar ADNg.